Changeset 3309


Ignore:
Timestamp:
10/25/07 13:12:20 (12 years ago)
Author:
melissa
Message:

Added support for Imaris 5.5 (HDF-based).

Location:
trunk
Files:
5 added
3 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/build.xml

    r3090 r3309  
    1818                   ome-java.jar (reflected) 
    1919                   poi-loci.jar (reflected) 
     20                   grib-5.1.03.jar (reflected) 
     21                   bufr-1.1.00.jar (reflected) 
     22                   slf4j-jdk14.jar (reflected) 
     23                   netcdf-4.0.jar (reflected) 
    2024    Targets:       style-formats 
    2125                   compile-formats 
     
    3842                   ome-java.jar 
    3943                   poi-loci.jar (bio-formats.jar) 
     44                   grib-5.1.03.jar (bio-formats.jar) 
     45                   bufr-1.1.00.jar (bio-formats.jar) 
     46                   slf4j-jdk14.jar (bio-formats.jar) 
     47                   netcdf-4.0.jar (bio-formats.jar) 
    4048                   visad-lite.jar 
    4149                   xmlrpc-1.2-b1.jar (ome-java.jar) 
     
    6775                   ome-java.jar (bio-formats.jar) 
    6876                   poi-loci.jar (bio-formats.jar) 
     77                   grib-5.1.03.jar (bio-formats.jar) 
     78                   bufr-1.1.00.jar (bio-formats.jar) 
     79                   slf4j-jdk14.jar (bio-formats.jar) 
     80                   netcdf-4.0.jar (bio-formats.jar) 
    6981                   xmlrpc-1.2-b1.jar (ome-java.jar) 
    7082    Targets:       style-plugins 
     
    8597                   ome-java.jar 
    8698                   poi-loci.jar (bio-formats.jar) 
     99                   grib-5.1.03.jar (bio-formats.jar) 
     100                   bufr-1.1.00.jar (bio-formats.jar) 
     101                   slf4j-jdk14.jar (bio-formats.jar) 
     102                   netcdf-4.0.jar (bio-formats.jar) 
    87103                   xmlrpc-1.2-b1.jar (ome-java.jar) 
    88104    Targets:       style-notes 
     
    104120                   ome-java.jar 
    105121                   poi-loci.jar (bio-formats.jar) 
     122                   grib-5.1.03.jar (bio-formats.jar) 
     123                   bufr-1.1.00.jar (bio-formats.jar) 
     124                   slf4j-jdk14.jar (bio-formats.jar) 
     125                   netcdf-4.0.jar (bio-formats.jar) 
    106126                   xmlrpc-1.2-b1.jar (ome-java.jar) 
    107127    Targets:       style-editor 
     
    217237               poi-2.5.1-final-20040804.jar, with bugfixes so that OLE v2 works 
    218238    License:   Apache 
     239 
     240NetCDF 
     241    JAR files: netcdf-4.0.jar, grib-5.1.03.jar, bufr-1.1.00.jar, slf4j-jdk14.jar 
     242    URL:       http://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf-java/ 
     243    Notes:     Used by Bio-Formats for Imaris 5.5 support. 
     244    License:   LGPL 
    219245 
    220246Skin Look and Feel 
  • trunk/loci/formats/in/ImarisTiffReader.java

    r3197 r3309  
    5959 
    6060    boolean little = (block[0] == 0x49 && block[1] == 0x49); 
     61    boolean big = (block[0] == 0x4d && block[1] == 0x4d); 
     62    if (!little && !big) return false; 
    6163 
    6264    int ifdlocation = DataTools.bytesToInt(block, 4, little); 
  • trunk/loci/formats/readers.txt

    r3202 r3309  
    6969loci.formats.in.ND2Reader          # nd2, jp2 [JAI-ImageIO] 
    7070loci.formats.in.PCIReader          # cxd [POIFS] 
     71loci.formats.in.ImarisHDFReader    # ims 
    7172 
    7273# TIFF-based readers with unique file extensions 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.