Changeset 7595


Ignore:
Timestamp:
01/26/11 22:25:13 (9 years ago)
Author:
curtis
Message:

Fix up LOCI Software POM structure.

Location:
trunk
Files:
1 deleted
14 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/legacy/jvmlink/pom.xml

    r7399 r7595  
    33  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
    44  xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 
    5     http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd"> 
     5    http://maven.apache.org/xsd/maven-v4.0.0.xsd"> 
    66  <modelVersion>4.0.0</modelVersion> 
    77 
    88  <parent> 
    99    <groupId>loci</groupId> 
    10     <artifactId>loci-base-pom</artifactId> 
    11     <version>1.06</version> 
     10    <artifactId>loci-base</artifactId> 
     11    <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1212  </parent> 
    1313 
    14   <groupId>loci</groupId> 
    1514  <artifactId>jvmlink</artifactId> 
    16   <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1715 
    1816  <name>JVMLink</name> 
     
    3129  <dependencies> 
    3230    <dependency> 
    33       <groupId>loci</groupId> 
     31      <groupId>${bio-formats.groupId}</groupId> 
    3432      <artifactId>loci-common</artifactId> 
    35       <version>5.0-SNAPSHOT</version> 
     33      <version>${bio-formats.version}</version> 
    3634    </dependency> 
    3735  </dependencies> 
     
    8684  </developers> 
    8785 
     86  <!-- NB: for loci-base, in case of partial checkout --> 
    8887  <repositories> 
    89     <!-- NB: for loci-base-pom --> 
    9088    <repository> 
    9189      <id>loci.releases</id> 
    9290      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/releases</url> 
    9391    </repository> 
     92    <repository> 
     93      <id>loci.snapshots</id> 
     94      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
     95    </repository> 
    9496  </repositories> 
    9597 
  • trunk/legacy/multi-lut/pom.xml

    r7399 r7595  
    33  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
    44  xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 
    5     http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd"> 
     5    http://maven.apache.org/xsd/maven-v4.0.0.xsd"> 
    66  <modelVersion>4.0.0</modelVersion> 
    77 
    88  <parent> 
    99    <groupId>loci</groupId> 
    10     <artifactId>loci-base-pom</artifactId> 
    11     <version>1.06</version> 
     10    <artifactId>loci-base</artifactId> 
     11    <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1212  </parent> 
    1313 
    14   <groupId>loci</groupId> 
    1514  <artifactId>MultiLUT</artifactId> 
    16   <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1715 
    1816  <name>Multi-LUT</name> 
    1917  <description>A demo application for visually exploring multi-spectral image data.</description> 
    20   <url>http://loci.wisc.edu/software</url> 
    2118  <inceptionYear>2001</inceptionYear> 
    2219 
     
    7067  </developers> 
    7168 
     69  <!-- NB: for loci-base, in case of partial checkout --> 
    7270  <repositories> 
    73     <!-- NB: for loci-base-pom --> 
    7471    <repository> 
    7572      <id>loci.releases</id> 
    7673      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/releases</url> 
    7774    </repository> 
     75    <repository> 
     76      <id>loci.snapshots</id> 
     77      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
     78    </repository> 
    7879  </repositories> 
    7980 
  • trunk/pom.xml

    r7590 r7595  
    33  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
    44  xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 
    5     http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd"> 
     5    http://maven.apache.org/xsd/maven-4.0.0.xsd"> 
    66  <modelVersion>4.0.0</modelVersion> 
    77 
    8   <parent> 
    9     <groupId>loci</groupId> 
    10     <artifactId>loci-base-pom</artifactId> 
    11     <version>1.06</version> 
    12   </parent> 
    13  
    148  <groupId>loci</groupId> 
    15   <artifactId>loci-software</artifactId> 
    16   <version>1.06</version> 
     9  <artifactId>loci-base</artifactId> 
     10  <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1711  <packaging>pom</packaging> 
    1812 
     
    3731  </modules> 
    3832 
     33  <properties> 
     34    <bio-formats.groupId>loci</bio-formats.groupId> 
     35    <bio-formats.version>5.0-SNAPSHOT</bio-formats.version> 
     36    <imagej.groupId>imagej</imagej.groupId> 
     37    <imagej.version>2.0-SNAPSHOT</imagej.version> 
     38    <imagej1.version>1.44l9</imagej1.version> 
     39    <!-- NB: Avoid platform encoding warning when copying resources. --> 
     40    <project.build.sourceEncoding>UTF-8</project.build.sourceEncoding> 
     41    <project.reporting.outputEncoding>UTF-8</project.reporting.outputEncoding> 
     42  </properties> 
     43 
     44  <build> 
     45    <defaultGoal>install</defaultGoal> 
     46    <extensions> 
     47      <extension> 
     48        <groupId>org.apache.maven.wagon</groupId> 
     49        <artifactId>wagon-webdav</artifactId> 
     50        <version>1.0-beta-2</version> 
     51      </extension> 
     52    </extensions> 
     53    <pluginManagement> 
     54      <plugins> 
     55        <plugin> 
     56          <artifactId>maven-assembly-plugin</artifactId> 
     57        </plugin> 
     58      </plugins> 
     59    </pluginManagement> 
     60    <plugins> 
     61      <plugin> 
     62        <artifactId>maven-compiler-plugin</artifactId> 
     63        <configuration> 
     64          <source>1.5</source> 
     65          <target>1.5</target> 
     66        </configuration> 
     67      </plugin> 
     68      <plugin> 
     69        <artifactId>maven-jar-plugin</artifactId> 
     70        <configuration> 
     71          <archive> 
     72            <manifest> 
     73              <addClasspath>true</addClasspath> 
     74            </manifest> 
     75          </archive> 
     76        </configuration> 
     77      </plugin> 
     78      <plugin> 
     79        <artifactId>maven-assembly-plugin</artifactId> 
     80      </plugin> 
     81    </plugins> 
     82  </build> 
     83 
     84  <reporting> 
     85    <plugins> 
     86      <!-- NB: Generate javadocs as part of site generation. --> 
     87      <plugin> 
     88        <artifactId>maven-javadoc-plugin</artifactId> 
     89      </plugin> 
     90    </plugins> 
     91  </reporting> 
     92 
     93  <organization> 
     94    <name>UW-Madison LOCI</name> 
     95    <url>http://loci.wisc.edu/</url> 
     96  </organization> 
     97 
     98  <issueManagement> 
     99    <system>Trac</system> 
     100    <url>http://dev.loci.wisc.edu/trac/software/</url> 
     101  </issueManagement> 
     102 
     103  <ciManagement> 
     104    <system>Hudson</system> 
     105    <url>http://dev.loci.wisc.edu:8080/</url> 
     106  </ciManagement> 
     107 
     108  <mailingLists> 
     109    <mailingList> 
     110      <name>LOCI Software</name> 
     111      <subscribe>https://lists.wisc.edu/read/all_forums/subscribe?name=locisoftware</subscribe> 
     112      <unsubscribe>https://lists.wisc.edu/read/?forum=locisoftware</unsubscribe> 
     113      <post>locisoftware@lists.wisc.edu</post> 
     114      <archive>https://lists.wisc.edu/read/?forum=locisoftware</archive> 
     115    </mailingList> 
     116  </mailingLists> 
     117 
     118  <scm> 
     119    <connection>scm:svn:http://dev.loci.wisc.edu/svn/software</connection> 
     120    <developerConnection>scm:svn:http://dev.loci.wisc.edu/svn/software</developerConnection> 
     121    <tag>HEAD</tag> 
     122    <url>http://dev.loci.wisc.edu/svn/software</url> 
     123  </scm> 
     124 
    39125  <repositories> 
    40     <!-- NB: for loci-base-pom --> 
     126    <!-- NB: for loci projects --> 
    41127    <repository> 
    42128      <id>loci.releases</id> 
    43129      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/releases</url> 
    44130    </repository> 
     131    <repository> 
     132      <id>loci.snapshots</id> 
     133      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
     134    </repository> 
     135    <!-- NB: for various dependencies --> 
     136    <repository> 
     137      <id>loci.thirdparty</id> 
     138      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/thirdparty</url> 
     139    </repository> 
     140    <!-- NB: for netcdf-java --> 
     141    <repository> 
     142      <id>unifi.it</id> 
     143      <url>http://ulisse.pin.unifi.it:8081/nexus/content/groups/open.repos</url> 
     144    </repository> 
     145    <!-- NB: for sezpoz --> 
     146    <repository> 
     147      <id>java.net</id> 
     148      <url>http://download.java.net/maven/2</url> 
     149    </repository> 
     150    <!-- NB: for netbeans --> 
     151    <repository> 
     152      <id>netbeans</id> 
     153      <name>Repository for hosting NetBeans API artifacts</name> 
     154      <url>http://bits.netbeans.org/maven2</url> 
     155    </repository> 
    45156  </repositories> 
    46157 
     158  <pluginRepositories> 
     159    <!-- NB: for maven-nar-plugin --> 
     160    <pluginRepository> 
     161      <id>loci.snapshots</id> 
     162      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
     163    </pluginRepository> 
     164  </pluginRepositories> 
     165 
     166  <distributionManagement> 
     167    <repository> 
     168      <id>loci.releases</id> 
     169      <name>LOCI Releases Repository</name> 
     170      <url>dav:http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/releases</url> 
     171    </repository> 
     172    <snapshotRepository> 
     173      <id>loci.snapshots</id> 
     174      <name>LOCI Snapshots Repository</name> 
     175      <url>dav:http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
     176    </snapshotRepository> 
     177  </distributionManagement> 
     178 
    47179</project> 
  • trunk/projects/curve-fitter/pom.xml

    r7575 r7595  
    33  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
    44  xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 
    5     http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd"> 
     5    http://maven.apache.org/xsd/maven-v4.0.0.xsd"> 
    66  <modelVersion>4.0.0</modelVersion> 
    77 
    88  <parent> 
    99    <groupId>loci</groupId> 
    10     <artifactId>loci-base-pom</artifactId> 
    11     <version>1.06</version> 
     10    <artifactId>loci-base</artifactId> 
     11    <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1212  </parent> 
    1313 
    14   <groupId>loci</groupId> 
    1514  <artifactId>curve-fitter</artifactId> 
    16   <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1715 
    1816  <name>Curve Fitter library</name> 
    1917  <description>A library for fitting single- or multi-component exponential decay curves to sample data.</description> 
    20   <url>http://loci.wisc.edu/software</url> 
    2118  <inceptionYear>2010</inceptionYear> 
    2219 
     
    3027 
    3128  <dependencies> 
     29    <dependency> 
     30      <groupId>${imagej.groupId}</groupId> 
     31      <artifactId>native-library-util</artifactId> 
     32      <version>${imagej.version}</version> 
     33    </dependency> 
    3234    <!-- TODO: define a real POM for akutan project 
    3335      See: http://sourceforge.net/projects/akutan/ --> 
     
    5153      <artifactId>jna</artifactId> 
    5254      <version>3.2.2</version> 
    53     </dependency> 
    54     <dependency> 
    55       <groupId>imagej</groupId> 
    56       <artifactId>native-library-util</artifactId> 
    57       <version>2.0-SNAPSHOT</version> 
    5855    </dependency> 
    5956  </dependencies> 
     
    9390  </developers> 
    9491 
     92  <!-- NB: for loci-base, in case of partial checkout --> 
    9593  <repositories> 
    96     <!-- NB: for loci-base-pom --> 
    9794    <repository> 
    9895      <id>loci.releases</id> 
    9996      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/releases</url> 
    10097    </repository> 
     98    <repository> 
     99      <id>loci.snapshots</id> 
     100      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
     101    </repository> 
    101102  </repositories> 
    102103 
  • trunk/projects/deep-zoom-plugin/pom.xml

    r7399 r7595  
    33  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
    44  xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 
    5     http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd"> 
     5    http://maven.apache.org/xsd/maven-v4.0.0.xsd"> 
    66  <modelVersion>4.0.0</modelVersion> 
    77 
    88  <parent> 
    99    <groupId>loci</groupId> 
    10     <artifactId>loci-base-pom</artifactId> 
    11     <version>1.06</version> 
     10    <artifactId>loci-base</artifactId> 
     11    <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1212  </parent> 
    1313 
    14   <groupId>loci</groupId> 
    1514  <artifactId>deep-zoom-plugin</artifactId> 
    16   <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1715 
    1816  <name>Deep Zoom plugin</name> 
    1917  <description>A Deep Zoom plugin for ImageJ.</description> 
    20   <url>http://loci.wisc.edu/software/</url> 
    2118  <inceptionYear>2010</inceptionYear> 
    2219 
     
    3128  <dependencies> 
    3229    <dependency> 
    33       <groupId>imagej</groupId> 
     30      <groupId>${imagej.groupId}</groupId> 
    3431      <artifactId>ij</artifactId> 
    35       <version>2.0-SNAPSHOT</version> 
     32      <version>${imagej1.version}</version> 
    3633    </dependency> 
    3734 
     
    6360  </developers> 
    6461 
     62  <!-- NB: for loci-base, in case of partial checkout --> 
    6563  <repositories> 
    66     <!-- NB: for loci-base-pom --> 
    6764    <repository> 
    6865      <id>loci.releases</id> 
    6966      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/releases</url> 
    7067    </repository> 
     68    <repository> 
     69      <id>loci.snapshots</id> 
     70      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
     71    </repository> 
    7172  </repositories> 
    7273 
    7374</project> 
    74  
  • trunk/projects/flow-cytometry/pom.xml

    r7399 r7595  
    33  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
    44  xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 
    5     http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd"> 
     5    http://maven.apache.org/xsd/maven-v4.0.0.xsd"> 
    66  <modelVersion>4.0.0</modelVersion> 
    77 
    88  <parent> 
    99    <groupId>loci</groupId> 
    10     <artifactId>loci-base-pom</artifactId> 
    11     <version>1.06</version> 
     10    <artifactId>loci-base</artifactId> 
     11    <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1212  </parent> 
    1313 
    14   <groupId>loci</groupId> 
    1514  <artifactId>flow-cytometry</artifactId> 
    16   <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1715 
    1816  <name>WiscScan Flow Cytometry</name> 
    1917  <description>Server application for flow cytometry with WiscScan.</description> 
    20   <url>http://loci.wisc.edu/software</url> 
    2118  <inceptionYear>2008</inceptionYear> 
    2219 
     
    3128  <dependencies> 
    3229    <dependency> 
    33       <groupId>imagej</groupId> 
    34       <artifactId>ij</artifactId> 
    35       <version>1.43</version> 
     30      <groupId>${bio-formats.groupId}</groupId> 
     31      <artifactId>bio-formats</artifactId> 
     32      <version>${bio-formats.version}</version> 
    3633    </dependency> 
    3734    <dependency> 
    38       <groupId>loci</groupId> 
    39       <artifactId>bio-formats</artifactId> 
    40       <version>5.0-SNAPSHOT</version> 
     35      <groupId>${bio-formats.groupId}</groupId> 
     36      <artifactId>loci-common</artifactId> 
     37      <version>${bio-formats.version}</version> 
    4138    </dependency> 
    4239    <dependency> 
    43       <groupId>loci</groupId> 
    44       <artifactId>loci-common</artifactId> 
    45       <version>5.0-SNAPSHOT</version> 
     40      <groupId>${bio-formats.groupId}</groupId> 
     41      <artifactId>ome-xml</artifactId> 
     42      <version>${bio-formats.version}</version> 
    4643    </dependency> 
    4744    <dependency> 
    48       <groupId>loci</groupId> 
    49       <artifactId>ome-xml</artifactId> 
    50       <version>5.0-SNAPSHOT</version> 
     45      <groupId>${imagej.groupId}</groupId> 
     46      <artifactId>ij</artifactId> 
     47      <version>${imagej1.version}</version> 
    5148    </dependency> 
    5249    <dependency> 
     
    103100  </developers> 
    104101 
     102  <!-- NB: for loci-base, in case of partial checkout --> 
    105103  <repositories> 
    106     <!-- NB: for loci-base-pom --> 
    107104    <repository> 
    108105      <id>loci.releases</id> 
    109106      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/releases</url> 
    110107    </repository> 
     108    <repository> 
     109      <id>loci.snapshots</id> 
     110      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
     111    </repository> 
    111112  </repositories> 
    112113 
  • trunk/projects/jar2lib/pom.xml

    r7399 r7595  
    33  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
    44  xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 
    5     http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd"> 
     5    http://maven.apache.org/xsd/maven-v4.0.0.xsd"> 
    66  <modelVersion>4.0.0</modelVersion> 
    77 
    88  <parent> 
    99    <groupId>loci</groupId> 
    10     <artifactId>loci-base-pom</artifactId> 
    11     <version>1.06</version> 
     10    <artifactId>loci-base</artifactId> 
     11    <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1212  </parent> 
    1313 
    14   <groupId>loci</groupId> 
    1514  <artifactId>jar2lib</artifactId> 
    16   <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1715 
    1816  <name>Jar2Lib</name> 
     
    9088  </developers> 
    9189 
     90  <!-- NB: for loci-base, in case of partial checkout --> 
    9291  <repositories> 
    93     <!-- NB: for loci-base-pom --> 
    9492    <repository> 
    9593      <id>loci.releases</id> 
    9694      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/releases</url> 
    9795    </repository> 
     96    <repository> 
     97      <id>loci.snapshots</id> 
     98      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
     99    </repository> 
    98100  </repositories> 
    99101 
  • trunk/projects/loci-checks/pom.xml

    r7399 r7595  
    33  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
    44  xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 
    5     http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd"> 
     5    http://maven.apache.org/xsd/maven-v4.0.0.xsd"> 
    66  <modelVersion>4.0.0</modelVersion> 
    77 
    88  <parent> 
    99    <groupId>loci</groupId> 
    10     <artifactId>loci-base-pom</artifactId> 
    11     <version>1.06</version> 
     10    <artifactId>loci-base</artifactId> 
     11    <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1212  </parent> 
    1313 
    14   <groupId>loci</groupId> 
    1514  <artifactId>loci-checks</artifactId> 
    16   <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1715 
    1816  <name>LOCI Checkstyle checks</name> 
    1917  <description>LOCI's Checkstyle extensions, for checking source code style.</description> 
    20   <url>http://loci.wisc.edu/software</url> 
    2118  <inceptionYear>2006</inceptionYear> 
    2219 
     
    7168  </developers> 
    7269 
     70  <!-- NB: for loci-base, in case of partial checkout --> 
    7371  <repositories> 
    74     <!-- NB: for loci-base-pom --> 
    7572    <repository> 
    7673      <id>loci.releases</id> 
    7774      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/releases</url> 
    7875    </repository> 
     76    <repository> 
     77      <id>loci.snapshots</id> 
     78      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
     79    </repository> 
    7980  </repositories> 
    8081 
  • trunk/projects/misc-plugins/pom.xml

    r7399 r7595  
    33  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
    44  xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 
    5     http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd"> 
     5    http://maven.apache.org/xsd/maven-v4.0.0.xsd"> 
    66  <modelVersion>4.0.0</modelVersion> 
    77 
    88  <parent> 
    99    <groupId>loci</groupId> 
    10     <artifactId>loci-base-pom</artifactId> 
    11     <version>1.06</version> 
     10    <artifactId>loci-base</artifactId> 
     11    <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1212  </parent> 
    1313 
    14   <groupId>loci</groupId> 
    1514  <artifactId>misc_plugins</artifactId> 
    16   <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1715 
    1816  <name>Miscellaneous ImageJ plugins</name> 
    1917  <description>Various plugins for ImageJ.</description> 
    20   <url>http://loci.wisc.edu/software</url> 
    2118  <inceptionYear>2010</inceptionYear> 
    2219 
     
    3128  <dependencies> 
    3229    <dependency> 
    33       <groupId>imagej</groupId> 
     30      <groupId>${imagej.groupId}</groupId> 
    3431      <artifactId>ij</artifactId> 
    35       <version>1.43</version> 
     32      <version>${imagej1.version}</version> 
    3633    </dependency> 
    3734  </dependencies> 
     
    5552  </developers> 
    5653 
     54  <!-- NB: for loci-base, in case of partial checkout --> 
    5755  <repositories> 
    58     <!-- NB: for loci-base-pom --> 
    5956    <repository> 
    6057      <id>loci.releases</id> 
    6158      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/releases</url> 
    6259    </repository> 
     60    <repository> 
     61      <id>loci.snapshots</id> 
     62      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
     63    </repository> 
    6364  </repositories> 
    6465 
  • trunk/projects/slim-curve/pom.xml

    r7593 r7595  
    33  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
    44  xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 
    5     http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd"> 
     5    http://maven.apache.org/xsd/maven-v4.0.0.xsd"> 
    66  <modelVersion>4.0.0</modelVersion> 
    77 
    88  <parent> 
    99    <groupId>loci</groupId> 
    10     <artifactId>loci-base-pom</artifactId> 
    11     <version>1.06</version> 
     10    <artifactId>loci-base</artifactId> 
     11    <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1212  </parent> 
    1313 
    14   <groupId>loci</groupId> 
    1514  <artifactId>slim-curve</artifactId> 
    16   <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1715  <packaging>nar</packaging> 
    1816 
    1917  <name>SLIM-Curve</name> 
    2018  <description>A package for exponential curve fitting of combined spectral lifetime image data.</description> 
    21   <url>http://loci.wisc.edu/software</url> 
    2219  <inceptionYear>2010</inceptionYear> 
    2320 
     
    9592  </developers> 
    9693 
     94  <!-- NB: for loci-base, in case of partial checkout --> 
    9795  <repositories> 
    98     <!-- NB: for loci-base-pom --> 
    9996    <repository> 
    10097      <id>loci.releases</id> 
    10198      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/releases</url> 
    10299    </repository> 
     100    <repository> 
     101      <id>loci.snapshots</id> 
     102      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
     103    </repository> 
    103104  </repositories> 
    104105 
    105   <pluginRepositories> 
    106     <!-- NB: for maven-nar-plugin --> 
    107     <pluginRepository> 
    108       <id>loci.snapshots</id> 
    109       <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
    110     </pluginRepository> 
    111   </pluginRepositories> 
    112  
    113106</project> 
  • trunk/projects/slim-plotter/pom.xml

    r7399 r7595  
    33  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
    44  xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 
    5     http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd"> 
     5    http://maven.apache.org/xsd/maven-v4.0.0.xsd"> 
    66  <modelVersion>4.0.0</modelVersion> 
    77 
    88  <parent> 
    99    <groupId>loci</groupId> 
    10     <artifactId>loci-base-pom</artifactId> 
    11     <version>1.06</version> 
     10    <artifactId>loci-base</artifactId> 
     11    <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1212  </parent> 
    1313 
    14   <groupId>loci</groupId> 
    1514  <artifactId>slim-plotter</artifactId> 
    16   <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1715 
    1816  <name>SLIM Plotter</name> 
     
    3129  <dependencies> 
    3230    <dependency> 
     31      <groupId>${bio-formats.groupId}</groupId> 
     32      <artifactId>bio-formats</artifactId> 
     33      <version>${bio-formats.version}</version> 
     34    </dependency> 
     35    <dependency> 
     36      <groupId>${bio-formats.groupId}</groupId> 
     37      <artifactId>loci-common</artifactId> 
     38      <version>${bio-formats.version}</version> 
     39    </dependency> 
     40    <dependency> 
     41      <groupId>${project.groupId}</groupId> 
     42      <artifactId>visbio</artifactId> 
     43      <version>3.40-SNAPSHOT</version> 
     44    </dependency> 
     45    <dependency> 
    3346      <groupId>jaolho.data</groupId> 
    3447      <artifactId>lma</artifactId> 
    3548      <version>1.3</version> 
    36     </dependency> 
    37     <dependency> 
    38       <groupId>loci</groupId> 
    39       <artifactId>bio-formats</artifactId> 
    40       <version>5.0-SNAPSHOT</version> 
    41     </dependency> 
    42     <dependency> 
    43       <groupId>loci</groupId> 
    44       <artifactId>loci-common</artifactId> 
    45       <version>5.0-SNAPSHOT</version> 
    46     </dependency> 
    47     <dependency> 
    48       <groupId>loci</groupId> 
    49       <artifactId>visbio</artifactId> 
    50       <version>3.40-SNAPSHOT</version> 
    5149    </dependency> 
    5250    <dependency> 
     
    9290  </developers> 
    9391 
     92  <!-- NB: for loci-base, in case of partial checkout --> 
    9493  <repositories> 
    95     <!-- NB: for loci-base-pom --> 
    9694    <repository> 
    9795      <id>loci.releases</id> 
    9896      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/releases</url> 
    9997    </repository> 
     98    <repository> 
     99      <id>loci.snapshots</id> 
     100      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
     101    </repository> 
    100102  </repositories> 
    101103 
  • trunk/projects/slim-plugin/pom.xml

    r7399 r7595  
    33  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
    44  xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 
    5     http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd"> 
     5    http://maven.apache.org/xsd/maven-v4.0.0.xsd"> 
    66  <modelVersion>4.0.0</modelVersion> 
    77 
    88  <parent> 
    99    <groupId>loci</groupId> 
    10     <artifactId>loci-base-pom</artifactId> 
    11     <version>1.06</version> 
     10    <artifactId>loci-base</artifactId> 
     11    <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1212  </parent> 
    1313 
    14   <groupId>loci</groupId> 
    1514  <artifactId>slim-plugin</artifactId> 
    16   <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1715 
    1816  <name>SLIMPlugin</name> 
    1917  <description>An ImageJ plugin for combined spectral-lifetime image analysis.</description> 
    20   <url>http://loci.wisc.edu/software</url> 
    2118  <inceptionYear>2010</inceptionYear> 
    2219 
     
    3128  <dependencies> 
    3229    <dependency> 
    33       <groupId>imagej</groupId> 
    34       <artifactId>ij</artifactId> 
    35       <version>1.43</version> 
     30      <groupId>${bio-formats.groupId}</groupId> 
     31      <artifactId>bio-formats</artifactId> 
     32      <version>${bio-formats.version}</version> 
    3633    </dependency> 
    3734    <dependency> 
    38       <groupId>imagej</groupId> 
    39       <artifactId>ij1-bridge</artifactId> 
    40       <version>2.0-SNAPSHOT</version> 
     35      <groupId>${imagej.groupId}</groupId> 
     36      <artifactId>ij</artifactId> 
     37      <version>${imagej1.version}</version> 
    4138    </dependency> 
    4239    <dependency> 
    43       <groupId>imagej</groupId> 
    44       <artifactId>ij1-plugin</artifactId> 
    45       <version>2.0-SNAPSHOT</version> 
     40      <groupId>${imagej.groupId}</groupId> 
     41      <artifactId>ij1-bridge</artifactId> 
     42      <version>${imagej.version}</version> 
    4643    </dependency> 
    4744    <dependency> 
    48       <groupId>imagej</groupId> 
     45      <groupId>${imagej.groupId}</groupId> 
     46      <artifactId>ij1-plugin</artifactId> 
     47      <version>${imagej.version}</version> 
     48    </dependency> 
     49    <dependency> 
     50      <groupId>${imagej.groupId}</groupId> 
    4951      <artifactId>ij2-imglib</artifactId> 
    50       <version>2.0-SNAPSHOT</version> 
     52      <version>${imagej.version}</version> 
     53    </dependency> 
     54    <dependency> 
     55      <groupId>${project.groupId}</groupId> 
     56      <artifactId>curve-fitter</artifactId> 
     57      <version>${project.version}</version> 
    5158    </dependency> 
    5259    <dependency> 
     
    5966      <artifactId>jfreechart</artifactId> 
    6067      <version>1.0.12</version> 
    61     </dependency> 
    62     <dependency> 
    63       <groupId>loci</groupId> 
    64       <artifactId>bio-formats</artifactId> 
    65       <version>5.0-SNAPSHOT</version> 
    66     </dependency> 
    67     <dependency> 
    68       <groupId>loci</groupId> 
    69       <artifactId>curve-fitter</artifactId> 
    70       <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    7168    </dependency> 
    7269    <dependency> 
     
    126123  </developers> 
    127124 
     125  <!-- NB: for loci-base, in case of partial checkout --> 
    128126  <repositories> 
    129     <!-- NB: for loci-base-pom --> 
    130127    <repository> 
    131128      <id>loci.releases</id> 
    132129      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/releases</url> 
    133130    </repository> 
     131    <repository> 
     132      <id>loci.snapshots</id> 
     133      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
     134    </repository> 
    134135  </repositories> 
    135136 
  • trunk/projects/utils/pom.xml

    r7399 r7595  
    33  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
    44  xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 
    5     http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd"> 
     5    http://maven.apache.org/xsd/maven-v4.0.0.xsd"> 
    66  <modelVersion>4.0.0</modelVersion> 
    77 
    88  <parent> 
    99    <groupId>loci</groupId> 
    10     <artifactId>loci-base-pom</artifactId> 
    11     <version>1.06</version> 
     10    <artifactId>loci-base</artifactId> 
     11    <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1212  </parent> 
    1313 
    14   <groupId>loci</groupId> 
    1514  <artifactId>utils</artifactId> 
    16   <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1715 
    1816  <name>LOCI Utilities</name> 
    1917  <description>A collection of simple utilities for which the choice of Java was probably inappropriate.</description> 
    20   <url>http://loci.wisc.edu/software</url> 
    2118  <inceptionYear>2006</inceptionYear> 
    2219 
     
    4744  </developers> 
    4845 
     46  <!-- NB: for loci-base, in case of partial checkout --> 
    4947  <repositories> 
    50     <!-- NB: for loci-base-pom --> 
    5148    <repository> 
    5249      <id>loci.releases</id> 
    5350      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/releases</url> 
    5451    </repository> 
     52    <repository> 
     53      <id>loci.snapshots</id> 
     54      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
     55    </repository> 
    5556  </repositories> 
    5657 
  • trunk/projects/visbio/pom.xml

    r7399 r7595  
    33  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
    44  xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 
    5     http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd"> 
     5    http://maven.apache.org/xsd/maven-v4.0.0.xsd"> 
    66  <modelVersion>4.0.0</modelVersion> 
    77 
    88  <parent> 
    99    <groupId>loci</groupId> 
    10     <artifactId>loci-base-pom</artifactId> 
    11     <version>1.06</version> 
     10    <artifactId>loci-base</artifactId> 
     11    <version>1.0-SNAPSHOT</version> 
    1212  </parent> 
    1313 
    14   <groupId>loci</groupId> 
    1514  <artifactId>visbio</artifactId> 
    1615  <version>3.40-SNAPSHOT</version> 
     
    3130  <dependencies> 
    3231    <dependency> 
     32      <groupId>${bio-formats.groupId}</groupId> 
     33      <artifactId>bio-formats</artifactId> 
     34      <version>${bio-formats.version}</version> 
     35    </dependency> 
     36    <dependency> 
     37      <groupId>${bio-formats.groupId}</groupId> 
     38      <artifactId>loci-common</artifactId> 
     39      <version>${bio-formats.version}</version> 
     40    </dependency> 
     41    <dependency> 
     42      <groupId>${bio-formats.groupId}</groupId> 
     43      <artifactId>ome-io</artifactId> 
     44      <version>${bio-formats.version}</version> 
     45    </dependency> 
     46    <dependency> 
     47      <groupId>${bio-formats.groupId}</groupId> 
     48      <artifactId>ome-xml</artifactId> 
     49      <version>${bio-formats.version}</version> 
     50    </dependency> 
     51    <dependency> 
     52      <groupId>${bio-formats.groupId}</groupId> 
     53      <artifactId>poi-loci</artifactId> 
     54      <version>${bio-formats.version}</version> 
     55    </dependency> 
     56    <dependency> 
     57      <groupId>${imagej.groupId}</groupId> 
     58      <artifactId>ij</artifactId> 
     59      <version>${imagej1.version}</version> 
     60    </dependency> 
     61    <dependency> 
    3362      <groupId>com.apple</groupId> 
    3463      <artifactId>AppleJavaExtensions</artifactId> 
     
    4473      <artifactId>looks</artifactId> 
    4574      <version>2.2.2</version> 
    46     </dependency> 
    47     <dependency> 
    48       <groupId>imagej</groupId> 
    49       <artifactId>ij</artifactId> 
    50       <version>1.43</version> 
    51     </dependency> 
    52     <dependency> 
    53       <groupId>loci</groupId> 
    54       <artifactId>bio-formats</artifactId> 
    55       <version>5.0-SNAPSHOT</version> 
    56     </dependency> 
    57     <dependency> 
    58       <groupId>loci</groupId> 
    59       <artifactId>loci-common</artifactId> 
    60       <version>5.0-SNAPSHOT</version> 
    61     </dependency> 
    62     <dependency> 
    63       <groupId>loci</groupId> 
    64       <artifactId>ome-io</artifactId> 
    65       <version>5.0-SNAPSHOT</version> 
    66     </dependency> 
    67     <dependency> 
    68       <groupId>loci</groupId> 
    69       <artifactId>ome-xml</artifactId> 
    70       <version>5.0-SNAPSHOT</version> 
    71     </dependency> 
    72     <dependency> 
    73       <groupId>loci</groupId> 
    74       <artifactId>poi-loci</artifactId> 
    75       <version>5.0-SNAPSHOT</version> 
    7675    </dependency> 
    7776    <dependency> 
     
    135134  </developers> 
    136135 
     136  <!-- NB: for loci-base, in case of partial checkout --> 
    137137  <repositories> 
    138     <!-- NB: for loci-base-pom --> 
    139138    <repository> 
    140139      <id>loci.releases</id> 
    141140      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/releases</url> 
    142141    </repository> 
     142    <repository> 
     143      <id>loci.snapshots</id> 
     144      <url>http://dev.loci.wisc.edu:8081/content/repositories/snapshots</url> 
     145    </repository> 
    143146  </repositories> 
    144147 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.